Hlavní areál nemocnice najdete v městské části Severní terasa, v ulici Sociální péče.
V areálu jsou umístěna téměř všechna oddělení a ambulance, včetně Akutního příjmu a Dětské pohotovosti.
Doporučená cesta městskou hromadnou dopravou z centra Ústí nad Labem:
Trolejbusem č. 87 – směr "Mírová" - zastávka "Severní Terasa".
Trolejbusem č. 80 - směr "Mírová" - zastávka "Masarykova nemocnice".
Autobusem č. 85 - směr "Strážky" - zastávka "Masarykova nemocnice".
Doporučená cesta městskou hromadnou dopravou ze Všebořic:
Autobusem č. 75 - směr "Pod Vyhlídkou" - zastávka "Masarykova nemocnice".
Doporučená cesta městskou hromadnou dopravou z Krásného Března:
Autobusem č. 75 - směr "obchodní centrum, Všebořice" - zastávka "Masarykova nemocnice".
Areál V Podhájí
Areál najdete v městské části Bukov, poblíž zimního stadionu
V areálu je umístěno oddělení Nukleární medicíny a Radioterapie.
Doporučená cesta městskou hromadnou dopravou z centra Ústí nad Labem:
Trolejbusy č. 84, 76 – směr "Všebořice"- zastávka "Městský stadion".
Autobusem č. 81 - směr "Přestanov" - zastávka "Městský stadion".